Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Usp9yF8VPU6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms