Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5160F8VPN3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5160F8VPN3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms