Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4933402N22RikF7D1B3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933402N22RikF7D1B3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.2 ms