Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm28038F7BCN9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28038F7BCN9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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