Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm17093F6XGJ4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms