Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pik3c2bE9QAN8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pik3c2bE9QAN8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms