Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Usp17lbE9Q9U0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Usp17lbE9Q9U0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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