Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Aknad1E9Q8N6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Aknad1E9Q8N6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms