Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga10E9Q6R1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga10E9Q6R1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms