Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm17175E9Q528 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms