Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rsph10bE9PYQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rsph10bE9PYQ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms