Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gcn1E9PVA8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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