Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930455H04RikD3Z622 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930455H04RikD3Z622 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms