Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptrhd1D3Z4S3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms