Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3676D3Z236 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3676D3Z236 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms