Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kpna7C0LLJ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms