Protein–RNA interactions for Protein: B6A8R8

Tarm1, T-cell-interacting, activating receptor on myeloid cells protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarm1B6A8R8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tarm1B6A8R8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms