Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf11cB4XVP9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf11cB4XVP9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms