Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc22a28B2RT89 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc22a28B2RT89 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms