Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Scn7aB1AYL1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Scn7aB1AYL1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms