Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PtpruB1AUH1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms