Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-M5A7VMS3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-M5A7VMS3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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