Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm6880A3KG45 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm6880A3KG45 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm6880A3KG45 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Gm6880A3KG45 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm6880A3KG45 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm6880A3KG45 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms