Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Htra4A2RT60 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Htra4A2RT60 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms