Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ism1A2ATD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ism1A2ATD1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms