Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tubb1A2AQ07 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb1A2AQ07 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms