Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rhbdl2A2AGA4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rhbdl2A2AGA4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms