Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Calcoco2A2A6M5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Calcoco2A2A6M5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms