Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam71e1A1L3C1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms