Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4921501E09RikA0A0R4J054 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms