Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trbv26A0A0B4J1P5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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