Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1J8

Tcrg-V4, T cell receptor gamma, variable 4 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tcrg-V4A0A0B4J1J8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms