Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28490A0A087WRT9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms