Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
Col5a3Q9JLI2 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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Col5a3Q9JLI2 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Col5a3Q9JLI2 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms