Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC173482.5-201ENSMUST00000224181 327 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
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Hoxd9P28357 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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Hoxd9P28357 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Hoxd9P28357 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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