Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm12610-201ENSMUST00000139272 581 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rabgef1Q9JM13 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rabgef1Q9JM13 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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