Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC125399.1-201ENSMUST00000224236 595 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Sh3bp1P55194 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Sh3bp1P55194 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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