Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm29345-201ENSMUST00000189213 399 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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Hoxc12Q8K5B8 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Hoxc12Q8K5B8 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxc12Q8K5B8 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxc12Q8K5B8 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxc12Q8K5B8 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxc12Q8K5B8 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxc12Q8K5B8 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Hoxc12Q8K5B8 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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