Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Scn4bQ7M729 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Olfr1136-201ENSMUST00000077471 1067 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Scn4bQ7M729 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Scn4bQ7M729 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Scn4bQ7M729 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Scn4bQ7M729 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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