Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Cldn34d-201ENSMUST00000114054 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Slc22a30-201ENSMUST00000064507 1888 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 1700010D01Rik-201ENSMUST00000096366 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm29563-201ENSMUST00000187249 496 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC154295.1-201ENSMUST00000217210 621 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm43665-201ENSMUST00000198672 1659 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm12543-201ENSMUST00000120410 543 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Ccdc18Q640L5 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms