Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 4930583I09Rik-201ENSMUST00000024896 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15095-201ENSMUST00000118996 1430 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 AC131743.1-201ENSMUST00000222138 4024 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm1866-201ENSMUST00000120701 477 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Sh3bp1P55194 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.5 ms