Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 AC131654.1-201ENSMUST00000219675 745 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Hoxb2P0C1T1 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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