Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Mir3080-201ENSMUST00000175010 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm10717-208ENSMUST00000179839 681 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29148-201ENSMUST00000188140 336 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
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ptchd1Q14B62 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ptchd1Q14B62 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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ptchd1Q14B62 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ptchd1Q14B62 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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