Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 4921515E04Rik-202ENSMUST00000226383 1738 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm24836-201ENSMUST00000122609 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37838-201ENSMUST00000194464 312 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 C530043A13Rik-203ENSMUST00000189247 3364 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxd9P28357 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms