Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 B230303A05Rik-202ENSMUST00000220728 478 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm22827-201ENSMUST00000083766 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Nyap2-203ENSMUST00000123285 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm43314-201ENSMUST00000196744 2231 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Trim35Q8C006 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Foxp1-206ENSMUST00000113326 7029 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28509-201ENSMUST00000189428 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm14241-201ENSMUST00000151260 264 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Trim35Q8C006 Gm28894-201ENSMUST00000185214 615 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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