Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Gm7832-201ENSMUST00000202613 880 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Irf5P56477 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Cnga1-201ENSMUST00000087213 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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Irf5P56477 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Irf5P56477 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Irf5P56477 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Irf5P56477 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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