Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Fam35a-206ENSMUST00000228626 3100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15812-201ENSMUST00000162331 748 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gml2-201ENSMUST00000096399 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Hoxd9P28357 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
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Hoxd9P28357 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Hoxd9P28357 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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