Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17190V9GX38 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm17190V9GX38 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17190V9GX38 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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