Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm3839S4R1W1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm3839S4R1W1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm3839S4R1W1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm3839S4R1W1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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