Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Top3bQ9Z321 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top3bQ9Z321 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms